Chức năng ban đầu của Apple Remote nhằm điều hướng trong Front Row, cho phép người dùng duyệt và phát nhạc, xem video (DVD và các tệp đã tải xuống) và duyệt ảnh. Mặc dù Front Row đã bị xoá bỏ từ OS X 10.7 và các đời sau, nhưng một vài phần mềm Apple vẫn có thể hoạt động với Apple Remote. Nó vẫn có thể được sử dụng để điều khiển các bản trình bày trong Apple Keynote (trên cả Intel Macs & PowerPC Macs), trình chiếu hình ảnh trong iPhoto và Aperture, chơi DVD thông qua DVD Player và phát video và audio trong iTunes và QuickTime. Một vài phần mềm khác tương thích với Apple Remote có thể kể đến như EyeTV 3.5 của Elgato và phương tiện phát VLC. Thiết bị vẫn có thể được sử dụng để trình chạy các bản trình bày trong Microsoft PowerPoint 2008 hay trong OpenOffice.org Impress.

Các chức năng khác có thể được điều khiển bởi Apple Remote có thể kể đến: đặt thiết bị vào chế độ nghỉ, chọn một phân vùng để khởi động và đẩy đĩa quang ra.[6] Một thiết bị có thể được cấu hình để nó chỉ đáp ứng tín hiệu với một điều khiển từ xa cụ thể.[7]

iPod

IPod với kết nối dock cùng bộ cảm biến hồng ngoại có thể được điều khiển nhạc và các phương tiện bởi Apple Remote.[8] Chức năng menu trên điều khiển từ xa không hoạt động trên iPod. Apple Remote cũng có thể dùng để điều khiển iPod Hi-Fi hoặc thiết bị của bên thứ ba phù hợp với nó.[9]

Boot Camp

Với bản đầu tiên Boot Camp 1.2, điều khiển từ xa đã có sẵn một số chức năng cho người dùng sử dụng hệ điều hành Windows. Nếu iTunes được cài đặt trên phân vùng Windows, nhấn nút Menu trên Apple Remote chương trình sẽ được tải. Chức năng điều khiển phương tiện của thiết bị cũng hỗ trợ cho Windows Media Player, cũng như các hệ thống điều khiển âm thanh.[10] Các chương trình của bên thứ ba khác cũng có thể sử dụng các khả năng của thiết bị điều khiển từ xa; các ứng dụng phương tiện như foobar2000 và Media Player Classic cho phép người dùng kiểm soát các chức năng của chúng thông qua điều khiển từ xa. Các ứng dụng phải được tập trung cho thiết bị điều khiển từ xa để điều khiển được chúng. Boot Camp 5, phiên bản mới nhất của phần mềm, có luôn cả các trình điều khiển cho thiết bị điều khiển từ xa.[11]